工程履约保函的有效期一般会在合同中约定，合同上约定的有效期截至日应为工程合同要求的竣工验收合格之后的一个月到半年，并会在保函中声明此确切日期。
由于工程履约保函都是在项目工程合同签订前后向银行申请的，有些比较大的项目工程工期往往估算的不准确，具体的完工工期很难确定，合同中一般协议是由业主觉得施工进度后来确定，所以延期完工的可能性还是很大的。
保函作为人的担保的一种，它与它所凭以开立的基础合同之间的关系是从属性亦或是独立的关系呢？据此，保函在性质上有从属性保函和独立性保函之分。传统的保函是从属性的，保函是基础合同的一个附属性契约，其法律效力随基础合同的存在、变化、灭失、担保人的责任是属于第二性的付款责任，只有当保函的申请人违约，并且不承担违约责任时，保证人才承担违约责任时，保证人才承担保函项下的赔偿责任。
而申请人是否违约，是要根据基础合同的规定以及实际履行情况来作出判断的，但这种判断显然不是件简单的事，经常要经过仲裁或诉讼才能解决其中的是非曲直。所以当从属性保函项下发生索赔时，担保人要根据基础合同的条款以及实际履行情况来确定是否予以支付。各国国内交易使用的保函基本上是从属性质的保函。