企业需要向相关主管部门提出申请，主管部门一般是当地市（县）住房和城乡建设局，申请时需要携带相关材料，主管部门会对相关材料进行初步审核，初审通过之后会将材料报水利行政主管部门进行审核，如果审核通过，相关部门将会在20个工作日内向申请人颁发资质证书，这样水利资质办理就结束了。
《中华人民共和国建筑法》第二十六条，承包建筑工程的单位应当持有依法取得的资质证书，并在其资质等级许可的业务范围内承揽工程。禁止建筑施工企业超越本企业资质等级许可的业务范围或者以任何形式用其他建筑施工企业的名义承揽工程。
特级企业：
1、取得施工总承包特级资质的企业可承担本类别各等级工程施工总承包、设计及开展工程总承包和项目管理业务；
2、取得房屋建筑、公路、铁路、市政公用、港口与航道、水利水电等专业中任意1项施工总承包特级资质和其中2项施工总承包一级资质，即可承接上述各专业工程的施工总承包、工程总承包和项目管理业务,及开展相应设计主导专业人员齐备的施工图设计业务。
3、取得房屋建筑、矿山、冶炼、石油化工、电力等专业中任意1项施工总承包特级资质和其中2项施工总承包一级资质，即可承接上述各专业工程的施工总承包、工程总承包和项目管理业务，及开展相应设计主导专业人员齐备的施工图设计业务。
4、特级资质的企业，限承担施工单项合同额6000万元以上的房屋建筑工程。
水利行业包括的工程内容有：河道整治、水库枢纽、灌溉排涝、引调水、水土保持、城市防洪、水文设施、围垦等。水利行业设计资质分为行业资质和专业资质。其中，行业资质设为甲、乙、丙三个等级，不同等级有不同的申请条件。以丙级资质为例，其申请条件主要从专业技术人员、技术负责人、注册资本、工作场所等方面进行考核。只有在各个方面分别达到相应标准，才有资格申请水利行业丙级设计资质。