草珊瑚的采收季节在秋季，以两年以上生长期的草珊瑚植株采收为宜，可以逐年采收，也可以两年采收一次。通常在金秋10月份左右，选择晴天来采收，采截部位通常设定于草珊瑚植株，地面枝干以上13㎝左右的位置。按照45°角用枝剪斜剪，避免伤口积水腐烂。取大枝留嫩枝，采集全株侧枝。截干采收以后，及时追肥，补给土壤养分。
种苗繁育可采用分株繁殖、扦插和种子繁殖，种子繁殖操作方便，育苗量大，成本低，更有利于在实际生产中推广。
1、分株繁殖
在早春或晚秋进行。先将野生植株地上部分离地面10厘米处割下入药或作为扦插材料，然后挖起根蔸，按茎秆分割成带根系的小株，按株行距20厘米×30厘米直接栽植大田。栽植后需连续浇水，保持土壤湿润。植株生长快，但成本高，繁殖系数低。
2、扦插繁殖
选择生长健壮、无病虫害为害的一年至二年生枝条，剪成15厘米～20厘米带两个节的插条。用吲哚丁酸(IBA)0.150.2克/升或萘乙酸（NAA）0.2克/升溶液浸泡插条基部2 h。扦插时间全年均可进行。扦插时在整好的畦面上开15 厘米深的横沟，将插条按株距5㎝斜摆入沟内，覆土压实，使插条与床面成45°，浇透水。
传统的采收方法以采收全株为主，药典所载也是以全株药用，草珊瑚野生分布地多为肥沃疏松的土壤，且根系浅，易于连根拔起，这种采集方法对草珊瑚药材资源是毁灭性的，是不可持续的。在人工栽培条件下，如采用采收全株的方法，也会大大增加种植年限和种植成本，而获得的产量并无明显增加。一般草珊瑚药材根部重量约占全株重量的10%左右，如果采收植株地上部分，虽然产量稍低，但每年都有收成，又能降低生产成本，达到可持续生产的目的。
在人工栽培条件下，应在种植3年后采收药材为好，草珊瑚药材有效成分异嗪皮啶含量在9月和10月较高，因此草珊瑚药材采收时间在每年的9月～11月份较适宜。在广西的自然条件下，9月～11月气候相对比较干燥，降雨少，植株的水分含量相对较低，此时开展药材采收工作，也有利于药材的干燥保存，方便运输。草珊瑚药材采收后在干净的晒场上晒干，有条件的也可进行烘干，即可作为原料药材出售。
经初加工的草珊瑚药材应用清洁、透气的包装袋包装。包装上应有清晰、牢固的标识，标识的内容含生产单位、产地、品种名称、采收日期、包装日期、联系方式等。药材经包装后应放置在干燥、阴凉、通风处贮藏。运输药材的工具必须清洁、干燥、无异味、无污染，运输过程中应注意防雨、防潮，同时不得与其它有毒、有害、有污染、易串味的物质混装。