北京同仁医院以医院综合医疗为主体，北京市眼科研究所、北京市耳鼻咽喉科研究所、北京市糖尿病研究所为附属科研机构，形成 “一院三所”发展格局，成为集医疗、教学、科研、预防、国际交流五位一体的医疗科研联合体。眼科、耳鼻咽喉科为国家临床重点学科，变态反应(鼻过敏)科为国家临床重点专科，中医眼科学为中医重点学科。
北京同仁医院作为首都医科大学第四临床医学院，医院承担着重要的教学任务;首都医科大学北京眼科学院和耳鼻咽喉科学院设在医院内。医院现有研究生学位点28个，其中博士学位点13个;硕士研究生导师163名，其中博士研究生导师67名，国家住院医师规范化培训专业基地16个。2012年以来，医院获批项目(课题)243项，获省部级及以上(含社会力量奖)31项，其中国家奖3项。
眼底外科主要针对眼底疾病进行诊疗，包括但不限于视网膜疾病、黄斑病变、青光眼等。这些疾病在眼底外科中都有专门的诊疗方法，包括治 疗、激光治 疗、手术治 疗等。如视网膜脱离通常需要进行手术治 疗，而黄斑病变可能需要或者激光治 疗，青光眼则可能需要、激光或者手术治 疗。眼底外科是关注眼底疾病的专科，对于这些疾病的诊治都有专门的方法和手段。
玻璃体视网膜疾病的临床工作是眼底病专业的核心工作方向和职责所在。年门诊量近19万人次，年手术量1.4万人次，高难度3-4级手术占比>97%。北京同仁医院眼底科在糖尿病视网膜病变、年龄相关性黄斑变性、视网膜静脉阻塞、视网膜脱离、脉络膜黑色素瘤等各类眼底疾病的诊疗方面具有丰富的经验。