档案盒按照摆放方式的不同，可以分为竖式和横式两种。之所以设计横式档案盒，是为了增加盒内文件与档案盒的接触面，避免文件竖置时“头重脚轻”而发生弯曲折损。从长远考虑，档案盒横放更有利于档案的保护。
实践中存在将盒号功能扩大化的倾向：
一是在归档章上增加盒号项目或将盒号标注于归档文件首页，将盒号作为归档文件与档案盒之间关联关系的纽带；
二是在电子文件整理中，为实现与纸质文件材料形式上一致，存在把盒作为整理单位，将电子文件以盒为单位进行整理的现象，这两种做法与盒号承载的功能都是相悖的。
实际上，在归档文件的件号已经与盒脊起止件号建立关联关系的情况下，没有必要再通过盒号，在归档文件与档案盒之间建立第二套关联关系。否则既成倍增加了工作量，有可能出现两套关联关系指向不一的情况，增加管理的复杂性。
档案盒盒脊可以根据机关单位的实际需要，与归档章项目相协调，编制其他项目。增减项目的工作应在同级档案行政管理部门的指导下进行。机关档案部门可对栏目位置及尺寸进行一定的调整，以规范、美观为原则。
档案盒发展进入第二个时期，也就是无酸纸档案盒。
档案文件盒用的纸张含酸量的高低是其寿命的指标，无酸纸指的是用pH值为7.0或更高的做出的纸，使用寿命可长达两百年。
无酸纸档案盒：颜色均匀，色淡，纸张表面光洁平整。相较于早期的牛皮纸档案盒，它不褪色，不变质，防霉还防虫，因而能能够更好的进行档案管理，保障了档案的归档与科学分类，做到分工细化。
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