1 不要使用给普通硬盘设计的磁盘优化软件，因为读写强度过大会对脆弱的微硬盘造成致命的伤害。硬盘播放器通常都会有“工程模式”，在里面可以对微硬盘进行清理复位等操作．比较方便。
硬盘采用的是磁介质，所以一定要使其远离磁场，否则会将硬盘磁化，丢失数据。常见的磁场源有音箱和手机等等。
2 不要在高温下使用，否则会使硬盘中晶振的频率发生变化。不过一般使用时不会出现这种特殊的温度条件。
使用时如是夏天．我们出汗较多，一旦硬盘潮湿后就会引起短路，毁坏硬盘。所以．平时在使用的过程中是能将硬盘播放器放置于专用的保护套中。这不仅能避免汗水的入侵，还能防止播放器外壳被硬物划伤。
3 由于硬盘跟闪存的工作方式不同，硬盘在读写时磁头和盘片接触十分近，这时如果受到强烈震动则可能损伤硬盘，轻则出现磁盘坏道，重则硬盘报废。所以我们不要在剧烈运动时携带硬盘播放器，平时给硬盘播放器戴上一个硅胶保护套，从而起到缓冲的作用。
4 一般来说厂商都会在产品中附带一个小布袋，或者使用上述的硅胶套，均可以防止划伤。
电池。硬盘播放器一般使用大容量的锂电池，对于锂电池来说，频繁的充电会减少电池使用寿命。所以一般情况下在电量将要用完的情况下再进行充电。如果电池是可以拆卸的，那么建议购买第二块电池，可以交替使用，也防止一块电池突然没电造成播放器无法使用的尴尬情况。
5 不要频繁的缠绕耳机线，防止内部断线。不要将音量调得过大，长时间大音量使用不仅会损伤耳机震膜，还可能损伤自己的耳朵，导致听力下降，严重者还可能致使耳朵失聪。